Создаваться такие университеты будут по решению президента РФ. ВУЗы создаются как автономные учреждения, а ректор будет назначаться правительством сроком на пять лет.
Кроме того, предполагается, что в федеральном университете обучение будет проводиться по программам, разработанным на основе собственных образовательных стандартов. Единственное условие состоит в том, что требования этих программ не должны быть ниже требований федеральных государственных программ. Кроме того, университет обязан учредить должность президента и сформировать попечительский совет.
Закон также предусматривает, что иностранцы, выпускники вузов, техникумов и колледжей (при поступлении в профильные вузы), а также лица с ограниченными физическими возможностями не будут сдавать ЕГЭ при поступлении в высшие учебные заведения, в том числе и в федеральные ВУЗы.
Всего в России планируется учредить порядка десяти федеральных университетов.